Synopsis
Mientras montan con Jack Atlas y Crow Hogan, el Dragón Stardust de Yuusei Fudou es capturado por Paradox, un misterioso Duelista Turbo del futuro, durante un Duelo Turbo y se convierte en un Monstruo Sin. Con la ayuda del Dragón Carmesí, Yuusei persigue a Paradox al entrar en un deslizamiento temporal, terminando en el pasado. Durante este tiempo, Paradox duela contra Jaden Yuki, quien todavía puede usar los poderes de Yubel y el Rey Supremo. Sin embargo, para ese momento, Paradox también había capturado al Dragón Cyber End y al Dragón Arcoíris, lo que abruma a Jaden. Él es salvado gracias a Yuusei y al Dragón Carmesí. Jaden informa a Yuusei sobre las verdaderas intenciones de Paradox. Al robar varios monstruos a través del tiempo y volverlos oscuros, planea matar a Maximillion Pegasus, el creador de Duel Monsters, impidiendo que el juego sea creado y causando que los eventos de las tres series nunca ocurran.